Việc tiệt khuẩn đối với các dụng cụ y tế phức tạp là rất cần thiết để đảm bảo an toàn cho bệnh nhân và xử lý dụng cụ y tế không phù hợp là nguyên nhân phổ biến gây nhiễm khuẩn. Ví dụ như Vụ dịch nhiễm Mycobacterium và Vụ dịch Pseudomonas aeruginosa đã được PGS TS Lê Thị Anh Thư đề cập trong bài chia sẻ về “tiệt khuẩn nhiệt độ thấp”. Vụ dịch nhiễm Mycobacterium có tổng cộng 35 bệnh nhân liên tiếp bị nhiễm trùng sau khi phẫu thuật nội soi ổ bụng. Nguyên nhân được xác định là do bộ dụng cụ không được xử lý đúng cách bằng hóa chất và nước tráng sau xử lý hóa chất, gây ra nhiễm khuẩn Mycobacterium Chelonae. Còn vụ dịch Pseudomonas aeruginosa có tổng cộng 4 bệnh nhân liên tiếp bị nhiễm sau khi sinh thiết đại tràng dưới sự hướng dẫn của siêu âm. Nguyên nhân được xác định là do kim sinh thiết không được tiệt khuẩn đúng cách.Những trường hợp này cho thấy rõ giá phải trả cho việc thất bại trong tiệt khuẩn dụng cụ.
Với sự tiến bộ trong phẫu thuật, ngày càng có nhiều dụng cụ y tế tinh vi không chịu được nhiệt độ cao. Điều này làm cho việc tiệt khuẩn trở nên khó khăn hơn. Ví dụ như các bộ dụng cụ phẫu thuật tim, dụng cụ phẫu thuật nội soi hay các dụng cụ phẫu thuật thần kinh đều rất nhạy cảm với nhiệt độ cao. Nếu sử dụng nhiệt độ cao để tiệt khuẩn, dụng cụ này có thể bị hư hỏng và không còn đảm bảo được tính hiệu quả trong quá trình điều trị bệnh nhân.
Theo khuyến cáo của CDC, tất cả các dụng cụ y tế phẫu thuật thiết yếu cần phải được tiệt khuẩn trước khi sử dụng. Việc này đặc biệt quan trọng đối với những dụng cụ đi vào mô vô trùng hay hệ thống mạch máu hay đi qua bất kỳ khoang dịch vô trùng nào của cơ thể. Đối với các dụng cụ chịu được nhiệt và độ ẩm, phương pháp tiệt trùng bằng hơi nước là phương pháp tốt nhất. Đối với các dụng cụ nhạy cảm với nhiệt độ thì cần được khử khuẩn bằng phương pháp tiệt trùng nhiệt độ thấp. Hiện nay, nhiều công nghệ tiệt trùng nhiệt độ thấp đã được phát triển để đáp ứng nhu cầu này.